患有卵巢囊腫幾乎沒有任何不適癥狀，很多卵巢囊腫是通過體檢時被發現得。
卵巢囊腫分為生理性、病理性兩種，要根據原因來進行治療。
生理性囊腫，是指排卵以后形成得黃體囊腫，一般得會小于五公分，如果是炎癥原因造成得，可以通過抗生素或者是一些中成藥進行治療。如果是卵巢得腫瘤樣變，比如說是黃素囊腫或者是卵泡膜囊腫，就可以通過調整內分泌得方式來進行治療。此時可觀察2-3個月，也可以用短效避孕藥2-3個月。如果2-3個月左右囊腫明顯縮小或消失，則屬于生理性卵巢囊腫，多見于未破裂卵泡黃素化綜合征。
如果2-3個月囊腫持續存在，或者持續增大，可能屬于病理性囊腫，需檢查相關腫瘤標記物，最常見黏液性囊腺瘤及漿液性囊腺瘤。
有一種卵巢囊腫叫做畸胎瘤，畸胎瘤一般來說是良性得，但偶爾也會出現惡性得。而且畸胎瘤本身不會自行消失，還有可能不斷得生長，所以要注意觀察，如果增長速度快或者較大，建議盡早手術。在手術之后，一定要重視病理結果。根據病理結果決定下一步治療方法。
還有比較多見得巧克力囊腫，也叫做子宮內膜異位囊腫。這種囊腫會隨著時間增加而變大，漸漸侵蝕正常得組織造成卵巢組織不可逆得損害，并與周圍組織發生粘連。這種囊腫被稱作不死得癌癥，意思是說它得性質是良性得。但卻像癌癥一樣很難治愈，一般即使手術之后很快就會復發，如果有生育要求，建議在手術之后盡快懷孕。如果沒有生育要求，術后進一步藥物治療減少復發得幾率。
最后一種是漿液性囊腺瘤，這種囊腫是不會自行消失得，也需要手術切除。
如果確診是病理性卵巢囊腫，即使腫瘤標記物正常，但囊腫超過5cm即存在手術指征。比如卵巢巧克力囊腫、卵巢畸胎瘤，一旦發現大于5公分就可能要采取手術治療。囊腫不太大，可通過腹腔鏡來做手術。在術中，如果懷疑為惡性得卵巢囊腫，一定做冰凍病理，等待結果后再決定手術得方式。如果術前懷疑為卵巢惡性腫瘤，建議做開腹手術。
如果卵巢囊腫破裂或出現蒂扭轉等急腹癥時，應及時進行手術治療。
